农村三格化粪池由相联的三个池子组成，中间由过粪管联通，主要是利用厌氧发酵、中层过粪和寄生虫卵比重大于一般混合液比重而易于沉淀的原理，粪便在池内经过30天以上的发酵分解，中层粪液依次由1池流至3池，以达到沉淀或杀灭粪便中寄生虫卵和肠道致病菌的目的，第3池粪液成为优质化肥。
农村三格化粪池处理设施，一般是与水冲式厕所相配套，由进粪管、分格池、连通管、盖板等部分组成。
一、设计原理
农村三格化粪池的结构设计应遵循的原则：
(1)第一池中应尽量保持足够高的有机物浓度;应有利于通过厌氧发酵自下而上形成“沉渣--粪液--浮渣”三层结构;应使粪便在池中能保持不小于1米的深度;
(2)进粪管的设计上应尽量减少水力学的冲击作用，以降低池底已沉淀的沉渣及寄生虫卵不致剧烈泛起，不致使已形成的表层浮渣被不断冲散。
(3)连通管的设计上，应尽量减少或防止未经厌氧发酵的新鲜粪便直接进入二池;尽量减少池底沉渣及寄生虫卵得以通过连通管流入二池;尽量使进粪管和连通管之间拉开距离;连通管的坡度越陡越好，莲蓬弯宜首选。
(4)第二池的作用为继续发酵池，在设计上应尽量避免或减少第一池新鲜粪便、浮渣、沉渣、寄生虫卵得以经连通管进入第二池;但因发酵需依赖高浓度的有机物及微生物，故其容积应小于第一池。
第一池
因为农村三格化粪池是要每天接纳新鲜粪便的，为了达到分解粪便中的有机物，杀灭病原体和去除寄生虫卵的目的，首先要求在第一池中为厌氧微生物的繁殖创造条件，使粪便中固相有机污物在厌氧环境下发酵分解成粪液和沼气。只要第一池建造得密封严密，使空气难以漏进，这样，原来空气中残存的一些氧气很快被好氧微生物消耗掉，形成没有氧气存在的厌氧环境。在厌氧微生物及尿素酶作用下，含氮有机物所生成的游离氨能透过细胞膜和卵壳将致病菌和虫卵细胞杀死。第一池粪便厌氧降解过程中，不断出现粪块松散，松散的粪块因发酵形成气泡而浮升液面，变成粪皮(浮渣)，粪皮能隔绝空气造成良好的厌氧环境，而粪便中比重较大的物质，又因散失气泡而下沉，变成粪渣(沉渣)，粪皮与粪渣之间常形成这种不稳定的上下梭动状态，虫卵因其比重大于粪液，则由粪块中释出并在粪液静止或流动缓慢的条件下逐渐下沉，于是在上层粪皮和底层粪渣之间出现一层粪水。但这一过程需要有一定时间，虽然在进粪时就会有粪水从第一池流入第二池，但需要在设计时使粪水在第一池有个适当长的水力停留时间。
对第一池，还要尽可能将新鲜的粪块，粪皮和粪渣全部截留在池内，进行发酵，避免漂流到第二池。为此，二池隔墙间的连通管安装位置的高低，管子口径的大小和形状都有讲究，使连通管既不会堵塞，又能截住粪渣，只让粪水顺畅地流过。一般常用连通管为莲蓬弯或斜插管，口径大小宜为内径100毫米。连通管下端距池底高度应为33厘米左右。这是由于这一高度正处在粪皮和粪渣两层之间的清液层中间，连通管的上端是粪水的流出口，为控制第一池粪液面的高低，一般距池底1米，距池顶200毫米。
另外，当进粪时，为了不使浮在粪液面上的粪皮冲散和沉在池底的粪渣和虫卵泛起，并尽可能保持粪液的平静，形成良好的厌氧和沉卵环境，一般要求进粪管设计成琵琶形状，并紧靠池壁以减小水冲力，口径大小宜为内径150毫米，进粪管下端沉入粪液面下，其深度约为粪液面高度的1/2处为宜。若进粪管下端处在粪液上，进粪时便会冲散粪皮，从而使粪皮涌入连通管而漂流人第二池。若进粪管口径不够大，进粪时会出现气涌现象而被堵住。同时为了尽量避免形成短路，在施工中应尽可能拉开进粪管和连通管之间的距离。
第二池
由于第一池的作用主要是发酵、沉卵、截留沉渣及浮渣，但其厌氧发酵无法达到充分杀灭病原菌和寄生虫卵的要求，所以有必要设置第二池，以补充第一池的不足，使粪液经过第二池处理后，流出的粪水能达到粪便无害化的基本要求。为此，要在第二池创造一个更好的厌氧发酵和沉卵环境。
由于第二池不像第一池那样受到进粪时的强烈扰动，而只是受到经连通管从第一池流过来的粪液轻微冲击，只要第二池同样建造得密封严密，便可使第二池有个较宁静的厌氧环境。由第一池流人第二池的粪液，在相对宁静的厌氧环境下能进一步发酵，虫卵比第一池更快地沉入池底。同时，经第二池深度厌氧发酵后，游离氨浓度上升，杀菌能力提高;另外，为细菌提供隐蔽的粪皮和粪渣显著减少，而粪液中的有机物含量仍旧很高，杂菌之间的拮抗作用仍旧存在，从而使有机代谢产物对病原菌及病毒能进一步发挥“杀灭作用”。故相比之下，第二池的灭菌效果和沉卵效果要稍高于第一池，按其生物学作用，第一池以发酵和沉卵为主，第二池以灭菌为主。
在设计上，应充分防止粪块、粪皮和粪渣流人第二池，由于主要发酵量已在第一池内完成。因此在第二池内粪液的平均停留时间相对可以短一些，也就是说，池的容积可以稍小于第一池。但在具体设计时，要为水冲式户厕在第一池内进行粪便发酵时，易能形成较厚的粪皮创造条件，同时又要为施工时便于作业，所以采取不缩小第一池容积，相应扩大第二池容积，不改变二池总的发酵停留时间的办法来实现。
第三池
从第三池流出的粪水，其所含的残渣和虫卵都已很少，基本上已达到粪便无害化卫生标准。因此，第三池的设置，除了能进一步促进沉卵和灭菌作用外，其主要目的是贮存粪水用于施肥。第三池容积大小，基本由施肥次数和每次施肥量来决定。若第三池的粪水不作肥料，而直接出口进行浅土渗滤法净化处理，则第三池的容积可以适当缩小。
农村三格化粪池外接净化沟或净化坑
农村三格化粪池第三池粪水的理想出路是用于农田施肥，但部分地区的农民以化肥代替粪肥因而粪水用量减少，为此必须要为多余粪水寻找合适的净化处理途径。
(一)净化原理
粪水浅土净化的道理，可简单归纳为：
1、利用浅层土壤微生物多，透气性好的特点，加快粪水中有机物的好氧分解;
2、粪水通过表层土壤毛细管渗透作用，扩大浅土净化面积;
3、粪水通过土壤表层蒸发和植被的升腾作用，不断使水份消失。
(二)净化装置
1、出水管--采用内径为lOO毫米，C18(200号)混凝土预制管。
2、净化沟--采用内径200毫米瓦简，在1000毫米长度内交叉均匀地钻直径lO毫米的孔20个，然后将每节瓦筒连接，埋入宽400毫米、深450毫米的土沟中，使管子略有坡度，沟壁铺聚乙烯薄膜，瓦筒外置填卵石，上面覆土植被。
3、净化坑--用直径700毫米、深600毫米的土坑，坑壁铺聚乙烯薄膜，内填卵石，上面覆土植被。
(三)注意事项
1)净化装置宜设在具有渗透性及较强毛细管作用土壤，以设在菜地、草坪为佳，表面不能用水泥覆盖;不应设在低洼地，若地势太低，可以培土填高。
2)净化装置应距离水井30米以上。
3)如三格化粪池粪水的出水量多，宜采用净化沟，出水量少，可用净化坑。
三格化粪池施工
(一)选址时，三格化粪池基础应与相邻原建筑物基础间保持一定净距，其数值一般取不小于相邻两基础底面的高差。
(二)开挖池坑时，对土质较好的地块，宜采用直壁开挖，使砖块紧贴坑壁砌筑;对土质差或有地下水的地块，只好采用按一定坡度的放坡开挖，并留不小于150毫米的回填宽度。回填时，可在回填土内掺人30%的碎石或碎砖瓦，要对称均匀，边砌筑边回填夯实，这样可对池墙起到捅箍作用。
(三)对地下水位高的地段，在开挖池坑前，先得在池位附近挖掘一口2米深的集水井，用泵抽吸井内积水。只有这样在不断排泄地下水的条件下，才可进行池坑开挖和完成建池任务。
